Freddie (Joaquin Phoenix) je vojni veteran koji se upravo vratio kući nakon što je odslužio vojni rok u mornarici. No, Freddie uskoro shvaća da ne može jednostavno nastaviti sa svojim životom zbog toga što su strahote Drugog svjetskog rata ostavile svoj trag i na njemu. On je obolio od PTSP-a te su vizije, zvukovi i slike rata još uvijek prisutni u njegovoj svijesti. Ubrzo Freddie upada u seriju psihotičnih ispada te mu se čini kako njegov život nema nikakvog smisla. Ipak, tada pronalazi misteriozni kult i njegovog karizmatičnog vođu Lancastera Dodda (Philip Seymour Hoffman) koji mu obećava pomoći.

Skrivena mana orginalan je krimić čiji je glavni junak drogom nabrijani detektivi Larry "Doc" Sportello (Joaquin Phoenix) koji istražuje nestanak bivše djevojke. Ovaj naizgled jednostavan kratki sinopsis krije vrlo kompleksnu i dinamičnu priču po kojima je Pynchon i postao poznat te koje su mu već godinama priskrbile vodeće mjesto na kladionicama kada je riječ o novim dobitnicima Nobelove nagrade za književnost.